Los recursos fitogenéticos son fundamentales para abastecer de genes los procesos de fitomejoramiento. Costa Rica posee una alta densidad de biodiversidad que debe ser aprovechada para dar origen a productos vegetales innovadores y de alto valor. Los investigadores contribuyen a conservar colecciones de germoplasma y trabajan en la bioprospección y caracterización de introducciones. Especial énfasis ha sido atribuído a las anonáceas, arándanos, papayas y guayabita del Perú (Strawberry guava).